Le site Natura 2000 Forêt de Moulière et Landes du Pinail a la particularité d'être désigné au titre des deux directives : Oiseaux et Habitats-faune-flore. Il en découle deux périmètres de site bien distincts :
- La Zone de Protection Spéciale ZPS qui englobe l'ensemble du massif de Moulière (forêt domaniale et bois privés) afin d'y préserver au mieux les oiseaux ;
- La Zone Spéciale de Conservation ZSC qui couvre uniquement "la petite forêt ou le Pinail" au nord du massif dont la moitié est occupé par des habitats de landes et de mares qui doivent être préservés pour leur caractère patrimonial et pour leurs espèces faunistiques et floristiques assez rares à l'échelle de la région et plus vastement de l'Europe.